Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms