Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms