Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDDC3Q8N4P3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDDC3Q8N4P3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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