Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms