Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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