Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PRAMEF20Q5VT98 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PRAMEF20Q5VT98 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PRAMEF20Q5VT98 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PRAMEF20Q5VT98 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PRAMEF20Q5VT98 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PRAMEF20Q5VT98 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PRAMEF20Q5VT98 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PRAMEF20Q5VT98 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PRAMEF20Q5VT98 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PRAMEF20Q5VT98 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAMEF20Q5VT98 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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