Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms