Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms