Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms