Protein–RNA interactions for Protein: Q30KP9

DEFB135, Beta-defensin 135, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB135Q30KP9 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DEFB135Q30KP9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms