Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBF2

WSCD2, WSC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD2Q2TBF2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WSCD2Q2TBF2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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