Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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