Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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