Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCK2Q16822 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms