Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
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