Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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