Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CDK5R1Q15078 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDK5R1Q15078 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms