Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLD3Q15054 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLD3Q15054 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
POLD3Q15054 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms