Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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