Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ATRQ13535 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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ATRQ13535 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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