Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PPP1R1AQ13522 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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