Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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