Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IFT88Q13099 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IFT88Q13099 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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IFT88Q13099 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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IFT88Q13099 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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