Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FOXF2Q12947 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FOXF2Q12947 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FOXF2Q12947 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FOXF2Q12947 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FOXF2Q12947 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FOXF2Q12947 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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FOXF2Q12947 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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