Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms