Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSME1Q06323 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms