Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN11Q06124 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms