Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms