Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms