Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms