Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP3K9P80192 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP3K9P80192 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms