Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TUB-202ENST00000305253 6420 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FAM46A-202ENST00000369754 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms