Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATXN3P54252 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN3P54252 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN3P54252 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN3P54252 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN3P54252 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATXN3P54252 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN3P54252 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN3P54252 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN3P54252 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATXN3P54252 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATXN3P54252 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATXN3P54252 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms