Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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