Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT9P35527 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT9P35527 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms