Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BMI1P35226 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BMI1P35226 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BMI1P35226 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BMI1P35226 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BMI1P35226 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms