Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PLNP26678 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PLNP26678 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PLNP26678 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms