Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CTSSP25774 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CTSSP25774 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CTSSP25774 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CTSSP25774 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CTSSP25774 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CTSSP25774 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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CTSSP25774 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTSSP25774 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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