Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms