Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 NME6-211ENST00000447314 621 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRHP20396 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRHP20396 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRHP20396 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRHP20396 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRHP20396 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHP20396 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHP20396 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHP20396 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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