Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NELFEP18615 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELFEP18615 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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