Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF4P18085 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF4P18085 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF4P18085 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF4P18085 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF4P18085 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF4P18085 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms