Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBTFP17480 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms