Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms