Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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