Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB6O95452 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB6O95452 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB6O95452 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB6O95452 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB6O95452 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB6O95452 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJB6O95452 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJB6O95452 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms