Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms