Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA6BA6NDN3 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA6BA6NDN3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA6BA6NDN3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA6BA6NDN3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA6BA6NDN3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA6BA6NDN3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA6BA6NDN3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA6BA6NDN3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA6BA6NDN3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA6BA6NDN3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms