Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms