Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSFQ9UBX1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSFQ9UBX1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSFQ9UBX1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSFQ9UBX1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSFQ9UBX1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSFQ9UBX1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSFQ9UBX1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSFQ9UBX1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSFQ9UBX1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSFQ9UBX1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms